En ese sentido, además del clásico contra Olimpia, Motagua mantiene rivalidades históricas con los dos clubes sampedranos (Marathón, con quien disputa el denominado «clásico de las M’s», y Real España, camiseta barcelona 2023 club con el cual engalanan el denominado -de manera no oficial- «clásico del buen fútbol»). Actualizado hasta el 13 de abril de 2022, Marathón 0:3 Motagua, y hasta el 29 de mayo de 2022, Real España 2:0 Motagua. En cuanto a selecciones nacionales, Motagua es el club hondureño que más jugadores ha aportado a la Selección de Honduras en Copas del Mundo -once en total- y Copas América -seis en total-, y el segundo que más lo ha hecho en Copas de Oro -cuarenta y uno en total-.
